Gamma, un robot creado para proteger la paz en el mundo, es modificado por el Dr. Wily en un arma anti-Mega Man en esta entrega de la serie. También marcó la primera aparición del fiel compañero canino robot de Mega Man, Rush. La adición de la capacidad de deslizarse expandió aún más la emocionante jugabilidad de acción. Proto Man, un personaje misterioso de intenciones desconocidas, también hizo su debut en esta emocionante historia.

Nota: Los detalles del juego se basan en la versión en inglés.